办公室（党委办公室）。拟订本单位综合工作制度、年度工作计划和税收宣传工作规划；承担公文处理、会务管理、信息调研、档案管理、机要保密、来信来访、值班值守、国家安全等工作；组织实施政务公开、政府信息公开、税收宣传、涉税舆情工作；组织实施督查督办工作；组织办理人大代表议案、建议和政协委员提案；承办党委文件、会议、督办等日常综合性事务。承担绩效管理工作；承担机关后勤事务的管理、保障和服务工作。
法制股。组织实施依法行政、普法、内部控制和推进海南自由贸易港建设工作；承担重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税务案件审理；组织办理行政复议、行政诉讼等事项；组织办理涉税反补贴案件应对工作；承担公职律师和法律顾问相关工作。组织实施税收执法督察，开展税（费）法律政策执行情况的监督检查；组织实施本单位税收执法责任制工作；督促落实督察审计发现问题的整改工作；协调配合外部监督和上级监督；参与实施“一案双查”工作。
税政一股。承担组织实施增值税、消费税、车辆购置税、企业所得税、个人所得税等和进出口税收、非居民所得居民境外所得的征收管理工作；承担相关税种和进出口税收具体业务问题的解释和处理；组织落实相关税种的税收优惠政策；承担增值税发票管理，组织相关信息系统的推广应用及管理；组织落实相关税种和进出口税收的日常管理、日常检查；参与相关税种和进出口税收、国际税收的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作；组织实施税收服务“一带一路”建设工作；承担外事管理。
税政二股。组织实施房产税、城镇土地使用税、土地增值税、契税、城市维护建设税、印花税、资源税、环境保护税、车船税、耕地占用税和烟叶税等征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；承担相关税种具体业务问题的解释和处理；组织落实相关税种的税收优惠政策；组织开展相关税种的日常管理、日常检查；参与相关税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作。
社会保险费和非税收入股。组织实施社会保险费和有关非税收入的征收管理工作；研究拟定具体实施办法；组织落实社会保险费和有关非税收入的日常管理、日常检查工作；参与社会保险费和有关非税收入征收的政策辅导、咨询服务、法律救济等工作。
收入核算股。研究拟订本单位税收、社会保险费和有关非税收入中长期规划，参与拟定税收、社会保险费和有关非税收入预算目标并依法组织实施；组织落实免抵调库年度安排；统筹协调组织收入工作，组织开展本单位税收经济分析工作，运用税收数据对本地经济运行情况开展动态监控分析；开展收入预测分析、预警分析和收入质量管理；承担重点税源监控、企业税收资料调查工作；组织落实会统核算、缴库退库、票证管理等制度，实施会计监督。
纳税服务股。组织开展纳税服务（含缴费服务，下同）工作；组织实施纳税服务制度和规范；组织开展面向纳税人和缴费人的税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作；承担办税服务厅等面向纳税人和缴费人的服务渠道管理；承担税收信用体系建设；办理纳税服务投诉和涉税违法举报；落实涉税专业服务监管政策及制度，统筹协调社会化纳税服务。
征收管理股。组织落实综合性税收征管法律、法规、规章及规范性文件，拟订具体操作办法；组织实施税务登记、纳税申报、普通发票管理等征管工作；组织实施征管质量监控评价；组织落实信息化规划、方案和制度，实施本单位信息化建设、考核评价和验收工作；承担税务行业标准和业务需求管理；承担信息化立项和预算管理。
税收风险管理股。承办风险应对任务的整合和推送；承担本单位税收风险管理模型构建、分析识别、任务推送、监控评价结果反馈等工作；承担各类税收数据、税（费）数据的集中管理、质量控制、分析应用、共享交换及税务云平台管理事项；组织、考核本单位风险管理工作。
财务管理股。贯彻落实本单位预决算管理、基建管理、会计核算管理、财务内控管理和政府采购、资产管理等规章、制度;拟订具体实施办法；审核汇编部门预算、决算，组织实施部门决算执行和公开工作；组织实施会计核算、会计基础规范工作；组织实施国库集中收付工，办理具体收付事项；拟订年度采购计划，办理具体采购事项；承担资产的购置、处置和使用管理等工作；承担税务着装管理工作；承担本单位财务管理工作；组织实施基建项目管理。
组织人事股。组织落实干部人事制度及税务人才队伍建设规划，拟订具体实施方案；承担人事、机构编制、公务员管理、教育培训、干部考核、离退休干部、数字人事等日常管理工作。承担工资、人事档案、专业技术职务管理等工作；监督检查干部人事规章制度执行情况；办理出国政审事项；指导本单位党的组织建设、党员队伍建设等工作。
机关党委（党建工作股）。协助本单位党委落实全面从严治党主体责任；督促本单位党组织落实管党治党责任，统筹和落实党群工作，宣传和执行党的路线方针政策；统筹本单位思想政治建设、意识形态建设、税务文化建设、精神文明建设和统战工作；配合实施巡察工作。
根据有关规定，设置党委纪检组，负责机关和派出机构党的纪律检查工作，组织开展本单位党的纪律检查工作。
